一天小马以前的女朋友丽姗从美国回来找他重叙旧情一无所知的小马从此陷入了阴谋危机中．．．丽姗对小马求助哭诉她的丈夫John对她实施虐待在忍无可忍中丽姗失手杀死了自己的丈夫John遂向小马求助John是美国有钱人经营赌场生意丽姗趁与John来港旅游之际杀死了John做成意外假象以继承财产一时冲动的小马不明所以帮丽姗处理了John的尸.延续前一集的剧情狮子亚历克斯（本·斯蒂勒 配音）、斑马马蒂（克里斯·洛克 配音）、长颈鹿迈尔曼（大卫·休默 配音）、河马格洛里亚（贾达·萍克·史密斯 配音）以及企鹅们为了能离开马达加斯加岛回到五光十色的纽约大家对一架破旧的失事飞机进行维修改造并成功起飞当大家已经开始庆祝终于可以回到纽约时飞机却意外降落迫降到了非洲大草原上在这儿狮子亚历克斯终于见到了它的父母但是由于生活习性上太多不一样而且言行举止各异使得这群纽约来的动物们显得格格不入这群昔日纽约中央公园的动物明星们在这野外艰难的环境中应该怎么办虽然在这儿遇见了自己的同类但因为习性不同使得自己无法完全融入他们的群体为了能融入环境与同类们建立良好的关系大家都施展出各种招式笑料百出🕠，
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